Менделевская рандомизация [Введение в литературу]: оценка риска раннего ожирения и рака молочной железы
Менделевская рандомизация [Введение в литературу]: оценка риска раннего ожирения и рака молочной железы

«Кажется, это недооцененная статья~

Давайте посмотрим, как автор планирует и излагает эту статью. Этот процесс стоит изучить:

Основные аналитические идеи статьи заключаются в этих двух предложениях:

Firstly, we performed a two-step MR to identify traits influenced by childhood body size that have a causal effect on breast cancer. Subsequently, traits were assessed in a multivariable MR analysis to assess the magnitude of their direct effect on breast cancer risk, followed by a mediation analysis to quantify the indirect effect.

——Двухэтапный методiМногомерный MR!!!

Реализация двухэтапного метода

Для каждого медиатора мы провели двухэтапный MR-анализ, где каждый этап представлял собой независимый одномерный двухвыборочный MR-анализ (рис. ii).

В первом 1 вмешаться,Воляbody sizeкак фактор воздействия,посредничество как результат;

В первом 2 вмешаться,Воляопосредующий факторкак фактор воздействия,Воляbreast cancerкак результат。

Многомерный МР

Давайте по очередиbody sizeикаждыйопосредующий Фактори риска рака молочной железы из взаимосвязи MVMR Анализ (рис. iii)。

Результат следующий:

Это позволило нам определить прямое влияние размера тела в детстве на риск рака молочной железы после учета каждого медиатора.

MVMR выполнялась только для медиаторов, которые продемонстрировали доказательства эффекта хотя бы на одном этапе двухэтапного подхода MR и для которых анализ чувствительности обоих этапов показал согласованные результаты (см. «Анализ чувствительности» и «Априорный анализ»).

Как видно из рисунка, с одной переменной MR Приходите виз Форма тела в детстве и рак молочной железыизобщий эффект OR по сравнению с,форма тела в детствеизпрямой эффект OR Между возрастом менархе и общим уровнем тестостерона. Это говорит о том, что влияние размера тела ребенка на рак молочной железы существенно не меняется после учета каждого потенциального медиатора.

Мы также провели два анализа отдельно, используя размер тела взрослого и рост ребенка в качестве третьего фактора воздействия MVMR (в дополнение к размеру тела ребенка и медиатору). Аналогичным образом, прямые эффекты размера тела в детстве существенно не изменились при наличии дополнительных воздействий.

анализ чувствительности

Чтобы исследовать возможные нарушения предположения MR и проверить надежность результатов MR с двумя выборками, полученных с помощью метода IVW, мы провели дополнительные MR-анализы с использованием метода MR-Egger и метода взвешенной медианы, оба из которых учитывают плейотропию. относительно стабильны.

Кроме того, перехват Эггера использовался для изучения того, существует ли потенциальная плейотропия направленного уровня, в то время как статистика Q Кокрана использовалась для количественной оценки степени гетерогенности между SNP, что указывало бы на наличие потенциальной плейотропии.

Анализ чувствительности MVMR включал тесты на прочность инструмента и горизонтальную плейотропию. Результаты анализа чувствительности использовались в качестве инструмента выбора для включения опосредующих факторов в последующие анализы.

наконец,дляhormoneсуществовать в чертахизнарушение Двухэтапный методMR Обязательные вопросы (двухэтапный подход) MR принадлежащий 1 шаг),«Проклятие победителя»,мы принялиКак разделить выборкурешить。Результаты этого анализаи Результаты анализа всех образцов согласуются。

«Как разделить выборку: двойная выборка MR Важным требованием для анализа является воздействие и результат. GWAS представляют собой два непересекающихся набора данных, что лучше, чем одна выборка MR Проклятие победителя и предвзятость антиконсервативного слабого инструмента в анализе (предвзятость победителя). curse and anti-conservative weak instrument предвзятость) и другие ограничения более выгодны. «Что касается влияния размеров тела в детстве на гормоны и некоторые репродуктивные характеристики, издвойная выборка MR Анализируя,Это требование не было выполнено,из-за посредникаGWASАнализ находится виосновное воздействие(форма тела в детстве)такой жеизочередь(Биобанк Великобритании)в ходе выполненияиз。 Чтобы преодолеть эту предвзятость и оценить степень влияния на результаты, мы повторили эксперимент. MR анализировать. “Это потому, что Биобанк Великобританииизразмер выборки большой:данныеодеялослучайным образом разделен на две части,Часть, использованная для нового анализа воздействия GWAS (размер ребенка),Другая часть используется для сравнения результатов.(гормон/репродуктивные характеристики)сделать новыйизGWASанализировать.Продлитьиз Изолированное воздействие образца GWAS Извлечение инструментов экспозиции (стр. <5×10-8),Повторите двашаг MR и MVMR изпервый шаг。 «Наконец, требование иметь две независимые выборки не распространяется на MVMR В анализе допустимо использовать экспозицию, т.е. экспозицию и факторы-медиаторы из UK Biobank.

посреднический анализ

Следующий,Мы провели посреднический анализ, используйте два шага MR、MVMR иобщий эффектиз оценка эффекта (i, дополнить данные 6), чтобы оценить косвенное влияние размера тела ребенка на риск рака молочной железы через выбранные медиаторы. Этот анализ ограничивается MVMR Опосредующие факторы, которые демонстрируют очевидные эффекты и имеют сильную инструментальную переменную силу.

Сравнение существующих изпосреднических методов посредством имитационного анализа анализметод,довольно высокийиз Уверенность выбранаProduct methodкак главныйпосреднический метод анализа и с Delta methodв ответиз SE/CI Оценочные техники.

Результаты косвенного воздействия:

Оценки косвенных эффектовявляется опосредующим эффектом воздействия наизобщий эффекткоэффициент(двашагMRпринадлежащийодиншаг)иопосредующее влияние на результатизпрямой эффекткоэффициент(MVMR)изпродукт,Метод продукта,95% CI рассчитывается на основе SE, оцененного методом дельты.

Список дополнительных материалов:

Воспроизведите эту статью и код на следующей неделе~
boy illustration
Углубленный анализ переполнения памяти CUDA: OutOfMemoryError: CUDA не хватает памяти. Попыталась выделить 3,21 Ги Б (GPU 0; всего 8,00 Ги Б).
boy illustration
[Решено] ошибка установки conda. Среда решения: не удалось выполнить первоначальное зависание. Повторная попытка с помощью файла (графическое руководство).
boy illustration
Прочитайте нейросетевую модель Трансформера в одной статье
boy illustration
.ART Теплые зимние предложения уже открыты
boy illustration
Сравнительная таблица описания кодов ошибок Amap
boy illustration
Уведомление о последних правилах Points Mall в декабре 2022 года.
boy illustration
Даже новички могут быстро приступить к работе с легким сервером приложений.
boy illustration
Взгляд на RSAC 2024|Защита конфиденциальности в эпоху больших моделей
boy illustration
Вы используете ИИ каждый день и до сих пор не знаете, как ИИ дает обратную связь? Одна статья для понимания реализации в коде Python общих функций потерь генеративных моделей + анализ принципов расчета.
boy illustration
Используйте (внутренний) почтовый ящик для образовательных учреждений, чтобы использовать Microsoft Family Bucket (1T дискового пространства на одном диске и версию Office 365 для образовательных учреждений)
boy illustration
Руководство по началу работы с оперативным проектом (7) Практическое сочетание оперативного письма — оперативного письма на основе интеллектуальной системы вопросов и ответов службы поддержки клиентов
boy illustration
[docker] Версия сервера «Чтение 3» — создайте свою собственную программу чтения веб-текста
boy illustration
Обзор Cloud-init и этапы создания в рамках PVE
boy illustration
Корпоративные пользователи используют пакет регистрационных ресурсов для регистрации ICP для веб-сайта и активации оплаты WeChat H5 (с кодом платежного узла версии API V3)
boy illustration
Подробное объяснение таких показателей производительности с высоким уровнем параллелизма, как QPS, TPS, RT и пропускная способность.
boy illustration
Удачи в конкурсе Python Essay Challenge, станьте первым, кто испытает новую функцию сообщества [Запускать блоки кода онлайн] и выиграйте множество изысканных подарков!
boy illustration
[Техническая посадка травы] Кровавая рвота и отделка позволяют вам необычным образом ощипывать гусиные перья! Не распространяйте информацию! ! !
boy illustration
[Официальное ограниченное по времени мероприятие] Сейчас ноябрь, напишите и получите приз
boy illustration
Прочтите это в одной статье: Учебник для няни по созданию сервера Huanshou Parlu на базе CVM-сервера.
boy illustration
Cloud Native | Что такое CRD (настраиваемые определения ресурсов) в K8s?
boy illustration
Как использовать Cloudflare CDN для настройки узла (CF самостоятельно выбирает IP) Гонконг, Китай/Азия узел/сводка и рекомендации внутреннего высокоскоростного IP-сегмента
boy illustration
Дополнительные правила вознаграждения амбассадоров акции в марте 2023 г.
boy illustration
Можно ли открыть частный сервер Phantom Beast Palu одним щелчком мыши? Супер простой урок для начинающих! (Прилагается метод обновления сервера)
boy illustration
[Играйте с Phantom Beast Palu] Обновите игровой сервер Phantom Beast Pallu одним щелчком мыши
boy illustration
Maotouhu делится: последний доступный внутри страны адрес склада исходного образа Docker 2024 года (обновлено 1 декабря)
boy illustration
Кодирование Base64 в MultipartFile
boy illustration
5 точек расширения SpringBoot, супер практично!
boy illustration
Глубокое понимание сопоставления индексов Elasticsearch.
boy illustration
15 рекомендуемых платформ разработки с нулевым кодом корпоративного уровня. Всегда найдется та, которая вам понравится.
boy illustration
Аннотация EasyExcel позволяет экспортировать с сохранением двух десятичных знаков.