1. Описание проблемы

• [Сообщение об ошибке]: сообщение об ошибке «Ошибка в данных Ops.frame(guide_loc, Panel_loc) :'==', определенное только для кадров данных одинакового размера, возникает при выполнении кода DimPlot.

2. Мыслительный процесс

• Вспомните, обновляли ли вы недавно версию Rstudio/R.
• Вспомните, были ли недавно обновлены какие-либо пакеты R. К числу наиболее влиятельных относятся: [Matrix, Seurat] и т. д.
• Используйте поисковую систему для поиска «Ошибка в данных Ops.frame(guide_loc, Panel_loc) :'==' определяется только для кадров данных одинакового размера».

https://github.com/satijalab/seurat/issues/8170

После нашего совместного расследования большинство из них указали на проблему с пакетом [ggplot2], поэтому первоначальное подозрение состоит в том, что это проблема с версией ggplot2. Мы используем руководство по кейсу, чтобы понизить версию до 3.4.x или 3.5.x. Но вы все равно обнаружите, что он все еще не работает. Затем проверьте, является ли Matrix версии 1.6 или выше. Рекомендуется перейти на версию 1.5.4.

3. Конкретные решения

• Понизьте версию пакета ggplot2 и Matrix, чтобы решить проблему.

# Введите R и выполните следующий код
R
devtools::install_version("ggplot2", version = "3.5.0")
devtools::install_version("Matrix", version = "1.5.4")

4. Проверка решения

5. Концовка

Лучше всего тщательно оценить потенциальные проблемы совместимости при обновлении пакетов R. Если вы хотите обновить Seurat, лучше всего использовать Docker для создания отдельной среды для выполнения старого или нового кода. Что касается использования докера в биоинформатическом анализе, вы можете прочитать мое предыдущее введение. На сегодня это все. Увидимся в следующий раз.

## Цитировать

https://ad.tebteb.cc [Анализ биологической информации с использованием облака биоинформатики]